シンガポールの独立以前はマレーシアリーグに「シンガポール・ライオンズ」というクラブが所属していた。1965年の独立後もこのクラブは1995年までマレーシアリーグに所属していたが、シンガポールでは1988年よりシンガポール・プレミアリーグが発足。1996年にはリーグを再編してSリーグが開幕した。
外国資本のクラブを積極的に受け入れており、日本からはアルビレックス新潟が参加しているほか、ブルネイ、マレーシア、過去には中国、フランス、アフリカからのチームも受け入れていた。国際大会ではAFCカップ第１回大会より参加。09、10年にはAFCチャンピオンズリーグにも参加している。